中国现代农业目前面临有以下六大困境：

1、有产量无品质

几十年来现代农业的发展，农产品的数量（产量）获得了极大的提升，完成了国人基本食品数量的需求。从此我们远离了粮票、肉票、油票等配给供应的阴影。随着物流运输业的发展，我们可以随时随地获得来自天南地北的各种农产品供应。

在满足数量供应的同时，我们不得不承担隐形的后果，即农产品的品质严重下降成为大多数民众并不知情的现象，即便他们觉得现在的东西没味道了，不好吃了，但也几乎很少有人去深究农产品的营养品质。

育种以高产为核心目标，化肥的超量使用也是为了高产、化学农药的使用也是为了保证高产，总之在产量面前，一切让路。还有谁关注农产品的营养品质呢？几乎各国所有涉及农产品营养品质研究的结论都指出，现在农产品的营养品质（营养密度）相较几十年前下降了50%-90%不等。食品营养不均衡造成的“隐形饥饿”已经成为普遍现象，这不得不说是现代农业的悲哀。

民以食为天，不仅仅是能吃饱，吃的本质还是获取足够全面均衡的营养，每天填塞了一大堆高热量不平衡的食品，给我们的健康带来了长远的健康隐患。

2、不可持续

现代石油农业的生产模式除了依靠机械化以外，主要是依靠消耗不可再生能源的投入来实现高产。但是站在资源转换的角度看，这是很荒谬的现象。以中国为例，我们每年消耗大约6000万吨化肥，生产了6亿吨粮食、近7亿吨蔬菜和3亿吨水果（以蔬菜为例，按照每人每天500克，大概足够36亿人吃一年）。这6000万吨化肥所消耗的不可再生资源：2亿吨优质煤、156亿立方米天然气和592亿度电。

3、环境污染

现代农业模式还造成了巨大的环境污染，除了开采矿物资源所造成的环境污染，还有过量使用化肥造成的土壤毁灭性的破坏，以及近7成的化肥造成的水体富营养化污染和氮氧化物排放污染。

4、比较效益低下

低品质农产品全面过剩，导致低价竞争，形成劣币驱逐良币的畸形市场。低价竞争的恶性循环进一步造成生产端效益越来越低，农民生产一亩地粮食的一年的纯收入不及在城市中打工一天的收入，如此的比较效益让更多的农民放弃了农业生产。

5、食品安全

化肥农药的大量使用，给农产品的安全带来了极大的威胁。打着符合国情旗号的、忽视了慢性中毒威胁的无公害标准早该被淘汰了，农产品安全的低标准意味着全社会要付出更大的医疗成本。

6、生态链破坏了

自然界原有的生态链被破坏，生态多样性被破坏。

环境污染严重、公共服务差、农产品有量无质、农民收入低......在未来农业道路中必须要解决这些问题。